医院放射医疗设备管理存在的首要问题是人员的缺乏和储备不足，医院工程技术人员的地位不高，人才的流失率非常高等，素质也良券不齐，缺乏必要的技术以及能力水平，这些现象在各级的医疗机构都非常常见。就本院医学工程队伍的构成情况来说，高职称以及高学历的医学工程人员所占比例非常小。对于医院工程技术人才缺乏的原因进行分析，不难看出很多医院出于对经济利益的考虑，只关注临床科室的发展，而缺乏对临床医学工程学科的重视[2]。在发展学科、培养人才、改善待遇和晋升职位等一些方面普遍存在着“重医轻工的现象，导致了临床医学工程科出现引进高新人才困难，缺少培训学习的机会，科研经费紧张有限的局面。 
由于医疗设备的使用与维修管理制度不够完善，大多数医院对于放射医疗设备的管理水平相对较低，例如非常多的医院都没有设置完备的医疗设备管理与维修的部门，设立了临床医学工程科等一些机构，因为他们权利和责任受到限制，很难发挥出有效的管理职能和管理作用。
由于放射医疗设备的内部构造的复杂度和精细度都比较高，技术含量很高，维修成本也相对偏高。再加上由于很多医疗设备生产的企业都严密地控制着这些产品的软、硬件以及核心技术的信息，对设备维修进行垄断，维修的费用也十分高昂。而医院由于对医疗设备的相关资金投入较为缺乏，维修和保养的技术和手段比较落后，甚至有些医院没有配备必要的检测维修设备和相关的维修配件。而这些传统落后的医疗设备的维修和保养方式，不仅不能够十分有效地排除医疗设备产生的故障，有时候甚至会严重影响到医疗设备的正常使用和运行，造成安全隐患。这对于医院放射医疗设备管理者来说是一个重要的难题。
很多医院都会购置放射医疗设备，都只看到了这些设备为医院带来的利益，却严重地忽略了设备管理和维修的问题，显示出了“重视使用，轻视维护”的管理局面。医院的工程技术人员十分缺乏技术培训的机会，从而使从事该项工作的技术人员难以提升自身的能力，不能够及时地了解和掌握先进的维修技术以及管理方法，在复杂多样的放射医疗设备产生故障的时候，往往会有一种束手无策的感觉。除此以外，一些医院会举办相关的讲座或培训，但培训的内容大多都是一些非常简单的设备维修以及基本操作，很难从根本上有效解地决所产生是复杂故障和现实问题